Lo primero es instalar el módulo PHP para sqlite
sudo apt-get install php-sqlite3 libsqlite3-dev -y
Ahora reinicia el servidor de Apache con:
sudo service apache2 restart
Luego activamos en Apache los módulos necesarios
nano /etc/php/[VERSION]/apache2/php.ini
Buscar:
;extension=pdo_sqlite
;extension=curl
;extension=sqlite3
Dejar sin el ";"
extension=pdo_sqlite
extension=curl
extension=sqlite3